1、绿色建筑增量成本计算方法不明确
绿色建筑增量成本计算目前尚无明确的绿色建筑增量成本计算方法，项目申报单位提出的数据不够专业，尤其是在计算"增量成本"时没有减去"标准值"，即标准建筑中采用相应技术的成本。例如，将地源热泵的成本直接算为增量成本而没有减去不采用地源热泵而用常规暖通技术的成本，由此造成计算成本过高，结果以为绿色建筑是高成本建筑。
采用绿色建筑技术不会导致成本大幅度攀升理由有三：
1、混淆了增量成本与总成本的概念，导致绿色建筑一定会大幅度增加成本的错误认识；
2、绿色建筑采用不同的技术路线可以使同一评价等级的绿色建筑增量成本产生较大差异，高星级不一定高成本才能达到。个别绿色建筑有绿色建筑技术堆砌的现象，过度"绿色"而造成不经济，不低碳；
3、绿色建筑零增量成本、低增量成本技术运用的越来越多，高增量成本的技术使用相对较少，使得绿色建筑增量成本呈下降趋势。
根据对中国城市科学研究会2012年评审的148个项目进行绿色建筑增量成本统计，居住项目一星级、二星级、三星级绿色建筑的增量成本分别为23.9元/平米、70.9元/平米、131.8元/平米，公建项目一星级、二星级、三星级绿色建筑的增量成本分别为29.9元/平米、87.3元/平米、216.4元/平米，通过绿色建筑经济性分析得知，除极个别绿色建筑项目外，一般绿色建筑项目在5~10年内均能收回绿色技术所带的成本增量。
2、绿色建筑不一定是高价
绿色建筑是一个广泛的概念，绿色并不意味着高价和高成本。比如延安窑洞冬暖夏凉，把它改造成绿色建筑，工程造价并不高;新疆有一种具有当地特色的建筑，它的墙壁由当地的石膏和透气性好的秸秆组合而成，保温性很高，再加上非常当地化的屋顶，就是一种典型的乡村绿色建筑，其造价只有800元/平方米，可谓价廉物美。
3、绿色建筑也不一定都是高科技
许多智能建筑，停留在保安、音响控制等方面，线路搞得非常复杂，造价也非常高，甚至耗电量居高不下，这不是智能建筑应有的发展道路。信息时代，智能化应该是多用信息，少用能源。现在有些地方推行智能开关，用手机就可以控制家里的能源开关，冬天走的时候，就把供热开关关掉，下班之前半个小时，手机一按，就能把供热开关启动，这样回到家里时，屋里已经暖洋洋的。主人在外边工作的时候，家中不供热，能省1/3的能源。再如，许多南方地区，房子里的空调40%是为了应对室外的阳光，安装一个很小的智能测温装置，当太阳光正热时，遮阳帘自动升起来，减少射入室内的阳光，就能减少空调的能耗。
4、绿色建筑不仅局限于新建筑
许多既有建筑是耗能大户，做一些小小的改造便能让既有建筑成为绿色建筑。例如一盏11瓦的节能灯相当于60瓦的白炽灯亮度;选用电子镇流器，较传统镇流器省电30%;变频式空调较常规的非变频空调节能20%至30%
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